Фашистські бомби впали на Дубно 22 червня 1941 року. Було зруйновано ряд  ,будинків, загинули мирні жителі. В цей же день у небі на південний захід від Дубна о   4 год. 25 хв. льотчик 46-го винищувального авіаполку, який дислокувався в Дубні, старший лейтенант Іванов Іван Іванович таранив, піднявшись з польового аеродрому поблизу Млинова, фашистський літак «ХЕ-111».  І.Іванову  посмертно присвоєно звання Героя Радянського Союзу  2 серпня 1941 року. 

     25 червня 1941 року Дубно зайняли частини німецької армії.

Німецька окупація міста тривала з 1941 по 1944 роки. Тут було організовано табір для військовополонених, де від голоду, хвороб і катувань загинуло 3200 радянських воїнів; єврейське гето, з якого вивезено і розстріляно близько 12 тисяч осіб; дитячий концтабір, як основний постачальник крові для німецьких шпиталів; в’язниця для заручників з числа цивільного населення, де загинуло багато представників дубенської інтелігенції.

У лютому 1944 року лінія фронту наблизилася до Дубна.

3 лютого на ділянці Дубно-Млинів до річки Ікви підійшла 13-та гвардійська кавалерійська дивізія 16-го гвардійського кавалерійського корпусу, яка вела бої з частинами поліцейської групи генерала Прюцмана і 454-ою охоронною дивізією у районі Дубно-Рівне. 

У ході Проскурівсько-Чернівецької операції 16 березня 1944 року радянські війська відновили наступ на Дубно. Бої   вели дві дивізії: 149-та під командуванням полковника А.А.Орлова, і 172-га – командир М.В.Коркішко.

Військам, які брали участь у визволенні міста, наказом Верховного головнокомандуючого від 17 березня 1944 року оголошена подяка, а в Москві був даний салют 12-ма артилерійськими залпами із 124-ьох гармат.

Фашистські окупанти завдали місту і району великих втрат. За далеко не повними даними на фронтах війни загинуло 613 жителів Дубна.

Всього в армію було мобілізовано по району 8716 чоловік.

У боях за визволення Дубна  і району смертю хоробрих загинуло 2390 воїнів, в тому числі 971 невідомий. Вони перезахоронені на військових меморіальних кладовищах міста та села Верба. Всього було 187 захоронень, зокрема 30 братських могил, 157 – одиноких.

За роки війни в Дубні знаходилось 7 пересувних польових  шпиталів, 3 евакошпиталі, 11 військових шпиталів знаходилось у населених пунктах району, в тому числі два у Варковичах і селах Вербі, Білогородці, Каменеці, Підлужжі, Софіївці, Микитичах, Панталії, Молодаві, Тараканові.